2007年7月15日至16日，中国共产党西南大学第一次代表大会胜利召开。这是西南大学组建以来召开的第一次党员代表大会，也是西南大学进入新的发展阶段召开的一次十分重要的代表大会，具有承前启后、继往开来的重要意义，对学校的建设、改革和发展将产生深远影响。大会主要任务是：以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，全面落实科学发展观，总结原两校党代会召开以来，特别是西南大学组建以来的工作成绩和经验，明确今后五年学校的奋斗目标和主要任务，选举产生西南大学第一届党的委员会和纪律检查委员会，团结动员全校共产党员和师生员工，同舟共济，顽强拼搏，开拓创新，为把西南大学建设成高水平综合大学而努力奋斗。
大会听取和审议了黄蓉生同志所作的题为《团结拼搏，开拓创新，为建设高水平综合大学而努力奋斗》的党委报告，审议了题为《深入推进学校党风廉政建设，为建设高水平综合大学提供强有力保证》的纪委书面报告，选举产生了中国共产党西南大学第一届委员会和第一届纪律检查委员会，原则通过了《西南大学章程》和《西南大学发展规划》。
7月15日上午早晨8点半，代表们迎着灿烂的朝阳，满怀信心和希望步入会场。9点整，中国共产党西南大学第一次代表大会在雄壮的国歌声中胜利开幕。出席本次大会的应到正式代表为268人，实到代表262人。
市委教育工委、市教委主要负责人、市委教育工委副书记邓卓明、市委教育纪工委书记刘路明、市委组织部组织二处处长张朝沂和北碚区委副书记蒋平等领导嘉宾、全体校领导、部分老领导、大会主席团成员在主席台就座。不是代表的两院院士，各民主党派主要负责人、在校的全国人大代表、全国政协委员，不是代表的二级单位党员主要负责同志和不是党员的学院院长列席大会。
大会由执行主席王小佳主持。市委组织部组织二处处长张朝沂宣读了中共重庆市委组织部《关于同意召开中国共产党西南大学第一次代表大会的批复》。张跃光同志宣读了中共教育部党组发来的贺信。北京师范大学、中国农业大学、武汉大学、中国农业科学院等34个单位党委发来贺信或贺电。
民主党派代表卢华语在大会上致辞，代表学校所有民主党派向中共西南大学第一次代表大会胜利召开表示热烈祝贺。
市委教育工委书记、市教委主要负责人代表市委教育工委、市教委讲话，希望本次代表大会产生的新一届西南大学党委和纪委领导班子要以深入学习贯彻重庆市第三次党代会精神为契机，进一步加强学校党的建设，不断推进基层党建工作创新；要切实加强领导班子自身建设，努力成为全校师生信赖的坚强领导集体；学校要以努力提高教育质量为目标，走以内涵提高为主的发展道路。
黄蓉生同志代表中国共产党西南大学委员会作报告。报告全面总结了原两校党代会召开以来，特别是西南大学组建以来的工作成绩和经验，客观地分析了学校改革发展所面临的形势，提出了学校办学指导思想、总体发展目标和今后五年的主要任务。
所有与会正式代表分成10个代表团，审议和讨论了党委、纪委报告。大家一致认为，黄蓉生同志代表学校党委所作的报告全面、实事求是地总结了过去几年的工作和基本经验，认真分析了学校改革发展面临的机遇和挑战，明确了学校今后一个时期的办学指导思想、发展目标、基本思路和主要任务。报告思路开阔，目标清楚，任务明确，鼓舞人心，对学校今后一个时期尤其是今后五年的改革、建设和发展具有十分重要的指导意义，对学校存在问题的分析深刻准确，今后发展规划宏伟务实，是一个振奋精神的报告，一个凝聚人心的报告。
代表们本着对党和学校改革发展事业高度负责的精神，针对学校党建和思想政治工作以及学校改革与发展中的许多重大问题，提出了许多中肯的、建设性的意见。
大会选举产生了新一届中共西南大学委员会委员和新一届中共西南大学纪律检查委员会委员；表决通过了关于中国共产党西南大学委员会报告的决议和关于中国共产党西南大学纪律检查委员会报告的决议，原则通过了《西南大学章程》、《西南大学发展规划》。
期间，大会听取了校长王小佳关于《西南大学章程》和《西南大学发展规划》的说明。王校长首先就大学章程的意义、作用、性质进行了阐述，对章程的起草、修订、讨论、审定等过程进行了说明。王校长强调，制定《西南大学章程》是学校依法办学和依法治校的需要，是学校客观发展实际的需要。王校长还重点就章程中“党委领导下的校长负责制”、“依法治校与民主管理”、“校院两级管理体制”、“教职工权利与义务”、“校庆日”等有关条款作了说明和阐述。
王校长对制定《西南大学发展规划》的背景、意义、原则作了阐述，就规划起草、修订、讨论以及本次大会期间代表们的意见和建议等作了说明，并重点围绕发展规划中有关办学指导思想、办学理念、发展定位、发展目标以及实施规划和实现发展目标的“三步走”等重要问题作了说明和阐释。
7月16日下午，大会胜利闭幕，黄蓉生同志致闭幕词。黄蓉生强调，新一届党委和纪委一定要按照“政治坚定、求真务实，开拓创新，勤政廉洁，团结协调”的要求，不断加强领导班子的思想政治建设和能力建设，努力提高领导班子驾驭学校改革发展全局的能力、科学判断形势的能力和应对复杂局面的能力，进一步密切同广大党员和师生员工的血肉联系，进一步发扬谦虚谨慎、不骄不躁、艰苦奋斗的作风，始终保持昂扬向上、励精图治的精神风貌，倍加珍惜全校共产党员的信任，倍加努力地为学校改革发展而勤奋工作，绝不辜负全体共产党员、全校师生员工的殷切希望，以优异的工作业绩来回报全体共产党员和师生员工的信任和支持。
会议期间，大会筹备工作领导小组还于7月15日晚上在学校音乐厅举行了全体代表参加的联谊晚会。晚会以歌颂伟大的党、伟大的祖国为主题，突出参与性、互动性，各代表团都报送了丰富多彩的节目参加表演，校离退休处秋韵合唱团、音乐学院教师、校团委学生艺术团参加演出，祝我校第一次党代会胜利召开。党员校领导以普通代表身份分别参加了各自代表团的节目表演，还集体上台激情朗诵了专门为本次党代会撰写的诗歌《新起点新征程新希望》。